以下是最佳免费在线 3D 蛋白质结构查看器网站的列表。任何在线分子结构查看器都可用于查看蛋白质的 3D 结构。在线分子查看器将分子数据文件作为输入，然后根据数据呈现结构。对于各种文件类型（包括 PDB、mmCIF、MRC、BRIX、CUB 等）也可以执行相同的操作。
这篇文章介绍了 6 个免费的在线分子结构查看器，您可以使用它们来查看 3D 蛋白质结构。所有这些查看器都支持各种分子数据文件并以 3D 形式呈现相应的结构。这些结构是交互式的，您可以按照自己喜欢的方式旋转、缩放、平移和剪辑。这些查看器还包含一些功能，可让您仔细分析结构。这包括选项分子显示和颜色选项以及其他基于用户的自定义。我建议您浏览列表以更详细地查看这些内容。
我最喜欢的 3D 蛋白质结构查看器
Mol* Viewer是此列表中我最喜欢的 3D 蛋白质结构查看器。该查看器包含多种选项，包括分子外观、定制、测量、分析和导出。
您还可以查看我们的最佳免费在线 GEDCOM 查看器网站、适用于 Windows 的分子查看器软件和适用于 Windows 的开源结构分析软件的列表。
Molstar.org（Mol* 查看器）
Mol* Viewer是最好的免费在线分子结构查看器之一。它是一个基于网络的现代开源工具包，用于大规模分子数据的可视化和分析。您可以上传任何分子结构文件并与其交互。事实上，您可以在同一平面中打开多个文件并一起查看它们。查看器是完全交互式的，您可以旋转、平移、缩放和剪辑结构。您还可以使用 7 个动画选项为结构制作动画。该查看器显示结构组件的树视图。这使您可以轻松浏览结构并分析不同的部分。您可以选择自定义每个组件的视图，您可以在其中自定义样式并更新模型。您还可以随意隐藏/取消隐藏组件。
有专门的组件和测量部分。两个部分都列出了各自的实体，以及更新组件和添加新测量的选项。最后但并非最不重要的一点是，它包含多个导出选项。您可以将结构的模型和几何形状导出为相应的文件格式。如果您选择对结构进行动画处理，还可以将该动画导出为 MP4 视频文件。
如何在 Mol* Viewer 中打开 3D 蛋白质结构？
- 使用下面给出的链接打开 Mol* 查看器。
- 单击屏幕左上角展开“主页”部分。
- 单击“打开文件”选项并选择“选择文件…”
- 选择要打开的分子结构文件，然后单击“应用”按钮。
- 这将在查看器中打开文件，您可以在其中与 3D 结构进行交互。
强调：
- 交互式查看器：允许旋转、平移、缩放、聚焦缩放和剪辑 3D 结构。
- 树视图：以树视图形式组织各种类型的组件。
- 活动记录器：使用时间戳记录与结构的每次交互。
- 自定义视图：提供多种视觉样式，并提供更新分子模型和应用不同操作（如3D 表示、边界框、变换构象等）的选项。
- 快照：结构当前状态的一键屏幕截图选项。
- 相机模式：在透视视图和正交视图之间切换。
- 组件：查看/添加结构中的各种类型的组件。
- 测量：查看/添加结构中各个组件的测量参数。
- 动画选项：轨迹动画、相机旋转、相机摇动、状态快照、展开装配和旋转结构。
- 导出选项：导出模型(mmCIF)、导出几何体（glb、stl、obj、usdz）和导出动画(MP4)。
RCSB.com（3D 视图）
RCSB 的 3D View是一款免费的分子查看器，可用于查看 3D 蛋白质结构。该分子查看器与所涵盖的 Mol* Viewer 非常相似。它几乎可以完成您可以使用该查看器执行的所有操作。它可以同时打开多个分子文件，并让您与结构进行交互。您可以使用所有选项来自定义结构的外观、视图尺寸和组件。它甚至还模仿相同的导出选项。唯一的区别是它不创建结构的树视图。
如何在RCSB的3D视图中打开3D蛋白质结构？
- 使用下面给出的链接转到 RCSB 的 3D 视图。
- 单击屏幕左上角的“导入”部分展开。
- 单击“打开文件”选项并选择“选择文件…”
- 选择要打开的分子结构文件，然后单击应用按钮查看 3D 结构。
强调：
- 交互式查看器：允许旋转、平移、缩放、聚焦缩放和剪辑 3D 结构。
- 活动记录器：使用时间戳记录与结构的每次交互。
- 自定义视图：提供多种视觉样式，并提供更新分子模型和应用不同操作（如3D 表示、边界框、变换构象等）的选项。
- 快照：结构当前状态的一键屏幕截图选项。
- 相机模式：在透视视图和正交视图之间切换。
- 组件：查看/添加结构中的各种类型的组件。
- 测量：查看/添加结构中各个组件的测量参数。
- 动画选项：轨迹动画、相机旋转、相机摇动、状态快照、展开装配和旋转结构。
- 导出选项：导出模型(mmCIF)、导出几何体（glb、stl、obj、usdz）和导出动画(MP4)。
iCn3D 结构查看器
iCn3D Structure Viewer是另一个功能丰富的查看器，用于在线打开和分析 3D 分子结构。该查看器包含广泛的功能，同时保持用户界面简单整洁。该集合包含各种分析功能，包括测序、注释、相互作用、距离、化学结合、对称性等。除此之外，它还包含样式和颜色选项，可根据您的喜好自定义外观。这是一款出色的 3D 分子查看器，不仅可以用于查看，还可以用于分析分子结构。
如何在 iCn3D Structure Viewer 中打开 3D 蛋白质结构？
- 使用下面给出的链接转到 iCn3D 结构查看器。
- 单击顶部功能区中的“文件”选项，然后选择“打开文件”选项。
- 然后上传您要打开的文件，然后单击“追加”按钮查看该文件。
强调：
- 交互式查看器：允许旋转、平移、缩放和聚焦缩放 3D 结构。
- 分子外观选项：用于更改各种组件的样式和颜色的多种选项。
- 分析：提供各种分析选项来分析结构的各个方面。
- 快照：结构当前状态的一键屏幕截图选项。
- 导出选项：导出分子结构（png、pdb 等）。
耶拿 3D 查看器
Jena 3D Viewer是一款在线 3D 分子查看器。您可以使用此查看器打开 3D 蛋白质结构。该查看器具有方便的功能来分析分子结构。它可以打开本地文件或通过 URL 从网络获取。它将 3D 结构渲染在屏幕左侧。您可以调整渲染窗口的大小并与 3D 结构交互。在右侧，您可以获得所有自定义选项。这包括原子选择、渲染、着色、立体和其他选项。您可以轻松配置这些选项以按照您想要的方式呈现结构。最重要的是，该查看器还可以使用命令来执行特定操作。例如，您可以通过执行命令来选择或显示/隐藏组件。
如何在 Jena 3D Viewer 中打开 3D 蛋白质结构？
- 使用下面给出的链接打开 Jena 3D 查看器。
- 单击展开“选择文件”选项并上传您的分子文件。或者在下面输入 URL 以从云端导入。
- 然后选择查看器类型并单击“执行”按钮打开文件。
强调：
- 交互式查看器：允许旋转、平移、缩放、聚焦缩放和剪辑 3D 结构。
- 活动记录器：使用时间戳记录与结构的每次交互。
- 自定义视图：渲染、分子着色、背景着色和其他选项。
- 快照：结构当前状态的一键屏幕截图选项。
- 脚本支持：使用命令执行特定操作，例如选择链、残基等。
Molsoft.com (PDBV)
Molsoft有一个交互式 PDB 快速查看器。您可以使用此查看器打开 3D 蛋白质结构并与它们交互。这是一个简单的视图，您可以在其中上传本地保存的分子文件或从您的 Google Drive 帐户获取它。当您上传文件时，它会在屏幕上呈现 3D 结构，您可以在其中与该结构进行交互。您可以根据自己的喜好定制一些分子外观选项。总的来说，它是一个不错的在线快速查看分子文件的工具。
如何在PDB Viewer中打开3D蛋白质结构？
- 使用下面给出的链接转到 PDB 查看器。
- 单击查看器右上角的汉堡菜单。
- 转到“打开”部分和您要查看的文件。
强调：
- 交互式查看器：允许旋转、平移、缩放和聚焦缩放 3D 结构。
- 分子外观选项：多个外观选项可更改显示样式、标签、测量值等。
- 自定义选项：允许按原子类型、链、NtoC、二级结构、B因子、对齐方式等对结构进行着色。
- 快照：结构当前状态的一键屏幕截图选项。
- 导出选项：导出分子结构（pdb 格式）。
RollMyFile.com
RollMyFile.com 是一个免费网站，您可以在线上传和打开各种类型的文件格式。它还支持不同类型的分子文件。当您打开分子结构文件时，它会以 3D 形式呈现该结构。渲染的结构是交互式的。查看器非常简单，并带有许多显示选项。这些显示选项允许您更改分子结构的外观。与其他查看器不同，此查看器还允许您编辑结构。您可以简单地选择一个元素并将其分子绘制在结构上的任何位置。
如何在RollMyFile.com上打开3D蛋白质结构？
- 使用下面提到的链接访问 RollMyFile 网站。
- 上传您的分子文件并等待其上传。
- 完成后，单击立即打开！按钮查看文件。
强调：
- 交互式查看器：允许旋转、平移、缩放和聚焦缩放 3D 结构。
- 分子外观选项：晶格、球棒、甘草、范德华、线框、力、网格和参考轴叠加。
- 编辑结构：简单地绘制具有所需键构型的各种元素的分子。
- 快照：录制结构自定义操作的视频。
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